Metodika navazuje na závěry studie „Zajištění synergických vazeb mezi operačními programy v programovém období 2007-2013“ realizované NOK-MMR v průběhu prosince 2008 až dubna 2009. Metodika byla projednána se zástupci dotčených ŘO, kteří byli nominováni jako odpovědní pracovníci pro oblast synergických vazeb mezi operačními programy v programovém období 2007-2013.
Aktualizace dokumentu souvisí se spuštěním funkčností v infromačních systémech (IS) MSC2007, MONIT7+ a BENEFIT7 umožňující evidenci synerigckých vazeb. Odráží připomínky a návrhy zástupců ŘO k navrženým postupům, které byly prezentovány na školení pro ŘO.